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機能性RNAの分子生物学 The molecular biology of non-coding RNA
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| はじめに 第�犠蓮ゝ’柔�RNA概論 はじめに 1-1. 機能性RNA 1-2. RNA ワールド 1-2-1. RNA ワールドへの道のり 1-2-2. RNA ワールド成立のシナリオの問題点 1-2-3. RNA の触媒機能は自己複製をサポートできるか？ 1-2-4. 自然選択によるランダムRNA 配列からのRNA 自己複製体の出現 1-2-5. RNA ワールドにおける翻訳の進化 1-2-6. RNA ワールドの前にはpre-RNAワールドが存在したか？ 1-2-7. RNAワールド仮説の今後 おわりに 第�蕎蓮�RNAの基礎 はじめに 2-1. RNA の化学構造および高次構造 2-1-1. ヌクレオチド、修飾ヌクレオチド 2-1-2. 一次構造から高次構造まで 2-1-3. RNA の構造モチーフ 2-1-4. RNA の構造と機能 2-2. RNA の分子生物学 2-2-1. 古典的な非翻訳RNA 2-2-2. 古典的な翻訳RNA 2-2-3. RNA のプロセシング おわりに 第�珪蓮�RNAの解析手法 はじめに 3-1. RNA の生化学的解析手法 3-1-1. 細胞からのRNA抽出、精製、分画 3-1-2. RNA の配列決定 3-1-3. RNAの合成 3-1-4. RNA-タンパク質複合体（RNP）の検出、精製、解析 3-1-5. まとめ 3-2. 構造生物学的手法 3-2-1. X 線結晶構造解析法 3-2-2. NMR法（二次構造解析 3-2-3. NMR法（立体構造解析 3-2-4. NMR法のための安定同位体標識 3-3. トランスクリプトーム解析とNon-coding RNA 3-3-1. 完全長cDNAプロジェク 3-3-2. 大規模な転写解析 3-3-3. RNA の二次構造とnon-coding RNA おわりに 第�絃蓮／�十〜数百ntの大きさを持つsmall RNA はじめに 4-1. 真正細菌のsmall RNA 4-1-1. 大腸菌RNomics 4-1-2. 大腸菌sRNA の分類 4-1-3. cis-encoded antisense sRNA 4-1-4. trans-encoded antisense sRNA 4-1-5. Hfq 4-1-6. 6S RNA 4-2. 真核生物のsmall RNA 4-2-1. snoRNA 4-2-2. U7 snRNA 4-2-3. 7SK RNA おわりに 第�江蓮�MicroRNAによる遺伝子発現の制御 はじめに 5-1. miRNAとsiRNA 5-1-1. 線虫の発生とmiRNA 5-1-2. miRNAの生合成 5-2. miRNAの作用機序 5-2-1. RNA 編集によるmiRNAの制御 5-2-2. 生殖細胞とsmall RNA 5-2-3. miRNAの標的となるmRNAとその予測 5-2-4. 形態形成、発生とmiRNA 5-2-5. 癌とmiRNA、その医療応用 5-2-6. 生体防御とmiRNA おわりに 第�詐�mRNA型non-coding RNA はじめに 6-1. mRNA型ncRNA の機能 6-1-1. 遺伝子量補正 6-1-2. bxd RNA によるホメオティック遺伝子の制御機構 6-1-3. steroid receptor RNA activator（SRA） 6-2. mRNA型ncRNA にコードされるペプチド おわりに 第�讃蓮／審棒己�における内在性アンチセンスRNA はじめに 7-1. 哺乳動物におけるアンチセンスRNA研究の歴史 7-2. ゲノム・トランスクリプトームレベルでの内在性アンチセンスRNA解析 7-2-1. センス−アンチセンスの定義 7-2-2. ゲノム解析によるアンチセンスRNA解析 7-3. 機能研究の進んでいる内在性アンチセンスRNA 7-3-1. 哺乳動物におけるX染色体不活性化にかかわるアンチセンスRNA（Tsix） 7-3-2. 哺乳動物のゲノム刷り込み現象にかかわるアンチセンスRNA 7-3-3. シロイヌナズナにおけるRNA干渉と内在性アンチセンスRNA 7-3-4. 分裂酵母における低分子RNAを介した遺伝子発現制御 7-4. 高等動物における内在性アンチセンスRNAのRNA干渉の関係 おわりに 第�湿蓮�mRNA上の調節機構 はじめに 8-1. mRNAのなかの機能調節エレメント 8-1-1. 真正細菌のmRNAに存在する転写制御エレメント 8-1-2. 真正細菌のmRNAに存在する翻訳制御エレメント 8-1-3. 真核生物のmRNAに存在する機能制御エレメント 8-1-4. ウイルスのmRNAに存在する機能制御エレメント 8-2. IRES 8-2-1. ウイルスのIRES 8-2-2. 細胞性のIRES 8-3. リボスイッチ おわりに 第�従蓮�RNAテクノロジー はじめに 9-1. 医薬品への応用例：アンチセンス法 9-1-1. アンチセンス法の作用機序 9-1-2. アンチセンスの核酸の修飾 9-1-3. アンチセンス核酸の導入法 9-1-4. アンチセンス医薬品 9-2. 試験管内選択法による機能性RNAの創出 9-2-1. アプタマーとSELEX法 9-2-2. SELEX 法の確立 9-2-3. さまざまなSELEX法 9-2-4. アプタマーの特徴 9-2-5. アプタマーの応用 9-2-6. 人工リボザイムの創出 9-3. RNA ナノ構造の構築 9-3-1. RNA モジュールの組合せによる安定なRNA構造のデザイン 9-3-2. RNA 三次相互作用による自己組織型RNA複合体の構築 9-3-3. RNA −ポリペプチド複合型会合体の構築 9-3-4. 新規機能性RNA-ポリペプチド複合体の構築 9-3-5. RNA 構造を部品として遺伝子発現スイッチをデザインする おわりに 謝 辞 執筆者略歴 立体構造図作成ソフト 索 引 解 説 RNA酵素（リボザイム）の発見 リボソームはRNA酵素だった ヌクレオチドのコンホメーション RNA塩基対の命名法 rRNAの修飾とプロセシング snoRNA の命名法とデータベース 古細菌のsmall RNA snoRNA と疾患 7SK RNAとTAR RNA：HIV-1ウイルスの戦略 植物のRNAiとノーベル賞 原核生物のRNA干渉―CRISPR システムの発見 mRNA型non-coding RNA という名称について アンチセンスRNAの定義に関する問題 RACE法 FANTOM Consortium Arabidopsis におけるDCLタンパク質 ポリアミンとRNA Macugen DNAアプタマー ペプチドのセレクション シュピーゲルマー（Spiegelmer） アロステリック・リボザイム column RNAワールド仮説成立の歴史を振り返って tRNA identityと私のアイデンティティー mRNAの5′末端キャップ構造 シュードノットの遺伝学による発見 miRNAの末端のリン酸化とtRNAのスプライシング RNA circuit BREAKER? No! Riboswitch! |